Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAPN12Q6ZSI9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms