Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms