Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00114Q6XXX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00114Q6XXX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms