Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATAD2Q6PL18 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATAD2Q6PL18 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms