Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms