Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms