Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1TD1Q5T7N2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms