Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms