Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms