Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf46Q504U0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms