Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms