Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms