Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PRKD1Q15139 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PRKD1Q15139 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PRKD1Q15139 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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