Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
R3HDM1Q15032 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
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