Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME4Q14997 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME4Q14997 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME4Q14997 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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