Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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