Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERV3-1Q14264 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms