Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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