Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3BQ13214 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms