Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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