Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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