Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 HER1YOR227W 3741 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YNL144CYNL144C 2223 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 RGA2YDR379W 3030 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 SLD5YDR489W 885 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YEA4YEL004W 1029 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 VAB2YEL005C 849 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YGL204CYGL204C 306 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 URA5YML106W 681 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 VTI1YMR197C 654 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 COA6YMR244C-A 315 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 MED8YBR193C 672 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YBR277CYBR277C 402 nt1.18□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 NUP192YJL039C 5052 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 TRZ1YKR079C 2517 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YCR090CYCR090C 549 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 SHR3YDL212W 633 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 PLP1YDR183W 693 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 ADK1YDR226W 669 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 RPN9YDR427W 1182 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YEL010WYEL010W 351 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YIL102CYIL102C 306 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 ECI1YLR284C 843 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YML084WYML084W 309 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 APA1YCL050C 966 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 HSH155YMR288W 2916 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 SFB2YNL049C 2631 nt1.17□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 RRP6YOR001W 2202 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 MES1YGR264C 2256 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 UBC9YDL064W 474 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 GPI19YDR437W 423 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YGL069CYGL069C 465 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 YKL115CYKL115C 393 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 snR44snR44 211 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 SHG1YBR258C 429 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 CCH1YGR217W 6120 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 HSE1YHL002W 1359 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 PDS5YMR076C 3834 nt1.16□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 NPR1YNL183C 2373 nt1.15□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 VPS16YPL045W 2397 nt1.15□□□□□ -2.22
CCW12Q12127 TVP15YDR100W 432 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 IRC4YDR540C 540 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YER189WYER189W 369 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 ALB1YJL122W 528 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 GRE2YOL151W 1029 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 CSH1YBR161W 1131 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 CFT2YLR115W 2580 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YPR089WYPR089W 2667 nt1.15□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 TRL1YJL087C 2484 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 MEI4YER044C-A 1227 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YGL242CYGL242C 546 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 AIM23YJL131C 1071 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 TPK3YKL166C 1197 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YPT52YKR014C 705 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 HRI1YLR301W 735 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 CSI1YMR025W 888 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YMR144WYMR144W 1029 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 RRT16YNL105W 429 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 ATX1YNL259C 222 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 UFE1YOR075W 1041 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YPR177CYPR177C 372 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 CAT2YML042W 2013 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 SIR4YDR227W 4077 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YIL166CYIL166C 1629 nt1.14□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 PRP6YBR055C 2700 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 MFB1YDR219C 1398 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 SLM1YIL105C 2061 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 GUK1YDR454C 564 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 RPL11BYGR085C 525 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 GTR2YGR163W 1026 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 FYV4YHR059W 393 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 HTD2YHR067W 843 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 TPM2YIL138C 486 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 PSF2YJL072C 642 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 RPA34YJL148W 702 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 VPS25YJR102C 609 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 CCW14YLR390W-A 717 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 SEN15YMR059W 387 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 FYV6YNL133C 522 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 BAG7YOR134W 1230 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 RPN8YOR261C 1017 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 RPL11AYPR102C 525 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 DAL5YJR152W 1632 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 VPS38YLR360W 1320 nt1.13□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 PKH3YDR466W 2697 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 HCS1YKL017C 2052 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 GNT1YOR320C 1476 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 SPC98YNL126W 2541 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 MAD1YGL086W 2250 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 RKM1YPL208W 1752 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YDL163WYDL163W 303 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 CTK2YJL006C 972 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 PFD1YJL179W 330 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 YBR013CYBR013C 390 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 PET20YPL159C 762 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 snR24snR24 89 nt1.12□□□□□ -2.23
CCW12Q12127 ARL1YBR164C 552 nt1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90.9 ms