Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms