Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2BP78356 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2BP78356 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms