Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FCGRTP55899 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms