Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB3P54753 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms