Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP2S1P53680 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms