Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NESP48681 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NESP48681 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NESP48681 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NESP48681 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NESP48681 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NESP48681 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NESP48681 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NESP48681 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NESP48681 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NESP48681 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NESP48681 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NESP48681 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
NESP48681 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NESP48681 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NESP48681 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NESP48681 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NESP48681 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NESP48681 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NESP48681 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NESP48681 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NESP48681 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NESP48681 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms