Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSSP48449 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSSP48449 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LSSP48449 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LSSP48449 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSSP48449 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSSP48449 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSSP48449 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSSP48449 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
LSSP48449 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSSP48449 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms