Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA4P48058 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms