Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4AP40617 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL4AP40617 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL4AP40617 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL4AP40617 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARL4AP40617 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms