Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA4P35212 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA4P35212 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA4P35212 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GJA4P35212 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJA4P35212 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJA4P35212 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJA4P35212 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJA4P35212 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJA4P35212 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJA4P35212 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms