Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms