Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRYBB3P26998 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRYBB3P26998 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms