Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL3RAP26951 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IL3RAP26951 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms