Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA6P23229 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms