Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT1P17948 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLT1P17948 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLT1P17948 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLT1P17948 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLT1P17948 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLT1P17948 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms