Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT10P13645 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT10P13645 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms