Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT3P12035 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT3P12035 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT3P12035 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT3P12035 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms