Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HKR1P10072 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HKR1P10072 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HKR1P10072 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms