Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV1-17P01599 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms