Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX58O95786 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX58O95786 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms