Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT3O95395 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms