Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATCO43716 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATCO43716 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATCO43716 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms