Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP2O00295 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP2O00295 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP2O00295 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms