Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF879B4DU55 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms