Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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