Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms