Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms