Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms